OmniScriptum SRL Vers un outil de modélisation biologique recommandant des sous-réseaux appropriés

La modelización es una tarea esencial en la biología de sistemas para describir sistemas biológicos complejos y predecir su comportamiento. Este libro se centra en los modelos computacionales que representan redes de reacciones bioquímicas. Dado que las redes de reacciones más grandes suelen ensamblarse a partir de redes ya existentes de modelos de acceso público, se necesitan herramientas que permitan encontrar y reutilizar fácilmente partes de modelos relacionados para integrarlas en un modelo en desarrollo. Aunque existen herramientas que ayudan al usuario a buscar, fusionar o combinar modelos, sigue siendo necesario un gran esfuerzo manual para llevar a cabo las tareas de reutilización. Además, la cantidad y la complejidad de los modelos publicados hacen que sea prácticamente inviable buscar manualmente las redes adecuadas. El objetivo de la investigación descrita en este libro es desarrollar métodos que sugieran a los usuarios subredes adecuadas para su integración durante el modelado. Los resultados obtenidos constituyen una base sólida para el desarrollo de un sistema de recomendación que proporcione a los modeladores sugerencias sobre cómo ampliar su modelo. Dicho sistema de recomendación facilita la reutilización eficiente de redes y reduce el esfuerzo manual necesario para encontrar e integrar estructuras relevantes.